在电视剧《越狱第二季》中，主角Michael Scofield为了拯救被冤枉的兄弟Lincoln Burrows，不惜抢劫银行并故意被关进了福克斯河州立监狱。Michael是一名建筑工程师，他了解监狱的建设蓝图，这成为了他计划越狱的关键。同时，监狱中的年长犯人改造官Bellick成为了Michael的导师，教会他如何在监狱中生存。此外，Michael还得到了狱友Sucre的帮助，开始与其他帮派广泛结盟，为越狱做好充分准备。

第一季结束时，Michael与几名狱友成功脱离福克斯监狱的封锁，实现了令人瞩目的逃脱。然而，第二季的开始标志着他们逃亡之路的开始，也意味着面临更多的危险和挑战。这八名逃犯成为了全国警力追捕的对象，在逃亡过程中，他们将面临各种困难和危险。

与此同时，Michael和Lincoln开始调查与政府阴谋有关的真相，因为林肯被陷害，这背后可能有更为黑暗的阴谋。兄弟俩决心揭开阴谋的真相，不仅是为了Lincoln的清白，也是为了曝光政府的黑暗行为。

逃离监狱的五名狱友分散在美国中部，每个人都面临着自己的困境和危机。有些人可能会被重新捕获，而另一些人则可能在逃亡途中失去生命。他们必须智慧和勇气，才能继续逃亡，避开警方的追捕。